【メモ帳】WSL Ubuntu18.04 再構築

環境崩壊

泣く泣く環境再構築。

Jupyter fortran kernel WSL 側から windows 側の IE を自動起動させる。

手順メモ帳

ベル音消す

echo "set bell-style none" >> ~/.inputrc
echo "set visualbell t_vb=" >> ~/.vimrc

apt

sudo apt update
sudo apt upgrade
sudo apt autoremove                                                                

gfortran

sudo apt install gfortran
sudo apt install gfortran-8
sudo apt install g++

gfortran-9

remove でテスト・リポジトリを消す。

sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-toolchain-r/test
sudo apt update
sudo apt install gfortran-9
sudo add-apt-repository --remove ppa:ubuntu-toolchain-r/test

X-window

echo "export DISPLAY=:0.0" >> ~/.bashrc
echo "export LIBGL_ALWAYS_INDIRECT=1" >> ~/.bashrc

sudo apt install x11-apps

ifort

coarray は調子悪い、composer 2020 beta update1 はライブラリが何かおかしい。また initial release 版でも image 数を少なめにしないと sync できずにストールしたりする。おなじく Windows でも update1 の coarray は実行時におかしい。sync に問題があるように見える。

ifort -coarray=shared -coarray-num-images=6

cp /mnt/d/parallel_studio_xe_2020_technical_preview_composer_edition.tgz .

tar zxvf parallel_studio_xe_2020_technical_preview_composer_edition.tgz 
cd parallel_studio_xe_2020_technical_preview_composer_edition/
sudo ./install_GUI.sh

echo "source /opt/intel/bin/compilervars.sh intel64" >> ~/.bashrc    

jupyter lab

apt で install すると、IE で立ち上がるようになる。必然的に sudo になる。pip で update するとおかしくなってしまうので、使用を避ける。

sudo apt install jupyter
sudo pip3 install jupyterlab   

fortran kernel

GitHub - f66blog/jupyter-ifort-kernel: Simple Fortran kernel for Jupyter

mkdir jupyter-kernels
cd jupyter-kernels/
cp -R /mnt/d/ubuntu18/jupyter-ifort-kernel/jupyter-ifort-kernel .

git clone https://github.com/f66blog/jupyter-ifort-kernel.git

pip3 install  --user ./jupyter-ifort-kernel
cd jupyter-ifort-kernel
jupyter kernelspec install ifort_spec --user

参考

windows 側の IE プロセス起動用のスクリプトがあるらし？（おかしくなった時のエラーメッセージからみて）

(/usr/share/jupyter/kernels/python3/kernel.json)
{
 "argv": [
  "/usr/bin/python3",
  "-m",
  "ipykernel_launcher",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ],
 "display_name": "Python 3",
 "language": "python"
}

make

sudo apt install make
sudo apt install cmake

ZMQ　おまけ

cp -R /mnt/d/ubuntu18/f08_zmq/ .

wget https://github.com/zeromq/libzmq/releases/download/v4.3.1/zeromq-4.3.1.tar.gz

tar zxvf zeromq-4.3.1.tar.gz
cd zeromq-4.3.1
./configure
make -j 8
sudo make install

flang

最新版 binary チェック Releases · flang-compiler/flang · GitHub

mkdir flang
cd flang 
wget https://github.com/flang-compiler/flang/releases/download/flang_20190329/flang-20190329-x86-70.tgz
tar zxvf flang-20190329-x86-70.tgz

.bashrc の尻に付加。

export PATH=$PATH:$HOME/flang/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$HOME/flang/lib

【無関係メモ帳】

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